Cô sinh ra trong một gia đình có truyền thống nghệ thuật cải lương gồm có cha là nghệ sĩ cải lương Hoài Châu, mẹ là nghệ sĩ cải lương Kim Hoa, bà ngoại là diễn viên tiền phong Tư Hélène, kép chánh Hai Long là ông ngoại và ông cố ngoại là nghệ sĩ tiền phong trong ngành hát bội pha cải lương Hai Núi, diễn viên Hề Ty và Ba Tẹt là ông cậu, thuộc về thế hệ thứ tư trong đại gia đình nghệ sĩ tài danh có 4 đời theo nghề hát từ thập niên 1930 đến nay. Gia đình của Ngân Quỳnh có bốn người con gái tài sắc đều là diễn viên sân khấu: Thanh Hằng, Ngân Quỳnh, Thanh Ngọc, NSND Thanh Ngân.